Частная статистическая практика · Санкт-Петербург

Статистический и биоинформатический анализ для медицинских исследований

Помогаем врачам, аспирантам и научным группам превращать сырые данные в публикуемые результаты. Рецензируемая методология, воспроизводимые отчёты на R, графики уровня Q1-журналов.

Обсудить проект Смотреть примеры работ
R · Python · ggplot2основной стек
Rmarkdownвоспроизводимые отчёты
FDR · Bonferroniкорректные поправки

Что мы делаем

Полный цикл — от планирования до публикуемого отчёта. Работаем с клиническими, экспериментальными и доклиническими данными.

📊

Описательная и сравнительная статистика

Описательные статистики, проверка нормальности, t-тесты, Манна–Уитни, Уилкоксона, Краскела–Уоллиса с пост-хок Данна, χ², точный тест Фишера.

📈

Регрессионные модели

Линейная и логистическая регрессия, GLM/GLMM, смешанные модели для повторных измерений, поправки на ковариаты, диагностика моделей.

⏱

Анализ выживаемости

Кривые Каплана–Майера, log-rank тест, многофакторная модель Кокса, проверка пропорциональности рисков, конкурирующие риски.

🧬

Биоинформатика

RNA-seq и микроматричные данные: DESeq2/limma, дифференциальная экспрессия, GO/KEGG enrichment, PCA, heatmap, кластеризация. 16S rRNA и метагеномика.

🔗

Корреляционный и многомерный анализ

Pearson/Spearman/Kendall, частные корреляции, PCA, факторный анализ, кластерный анализ, сетевые графы корреляций.

📐

Дизайн исследования

Расчёт размера выборки и мощности, выбор статистических тестов под дизайн, рандомизация, план анализа (SAP) до начала исследования.

🎨

Научная визуализация

Публикуемые графики ggplot2 уровня Q1-журналов, тепловые карты, volcano plots, forest plots, под требования конкретного журнала.

📄

Воспроизводимые отчёты

Rmarkdown / Quarto-отчёты с кодом, графиками и интерпретацией. Каждый шаг анализа документирован и может быть воспроизведён.

🩺

Поддержка диссертаций и публикаций

Раздел «Материалы и методы», «Статистический анализ», подготовка таблиц и рисунков, ответы на замечания рецензентов.

Методы и инструменты

Подбираем методы под данные, а не наоборот. Никаких «t-тест на всё подряд».

Параметрические тесты

  • t-тест Стьюдента (парный/непарный, Уэлча)
  • Однофакторный и двухфакторный ANOVA
  • Repeated-measures ANOVA
  • Пост-хок Tukey HSD, Bonferroni

Непараметрические тесты

  • Mann–Whitney U, Wilcoxon signed-rank
  • Kruskal–Wallis с пост-хок Данна
  • Friedman test для повторных измерений
  • Перестановочные тесты (permutation)

Регрессии и моделирование

  • Линейная и множественная регрессия
  • Логистическая, пуассоновская, отрицательно-биномиальная
  • Mixed-effects (lme4, nlme)
  • GAM, регрессия с ограниченными сплайнами

Выживаемость

  • Kaplan–Meier, log-rank
  • Cox proportional hazards
  • Time-dependent covariates
  • Конкурирующие риски (Fine–Gray)

Поправки на множественные сравнения

  • Bonferroni, Holm
  • FDR Benjamini–Hochberg
  • Storey q-value
  • Westfall–Young permutation

Биоинформатические пакеты

  • DESeq2, edgeR, limma — DEG
  • clusterProfiler, fgsea — обогащение путей
  • ComplexHeatmap, EnhancedVolcano
  • phyloseq, DADA2 — 16S метагеномика

Примеры работ

Реальные проекты и демо-кейсы. Полные отчёты — по клику на кейс.

Тепловая карта показателей
Клиническое исследование · Дерматология

Эффективность стресслимитирующей системной терапии с применением нейрокосметики

Сравнительное исследование двух групп пациентов: описательная статистика, корреляционный анализ исходных показателей, внутригрупповая динамика (Уилкоксон), межгрупповое сравнение конечных точек, тепловая карта профиля изменений, корректный учёт множественных сравнений.

  • Wilcoxon signed-rank
  • Корреляционные сети
  • FDR-поправка
  • Полный Rmarkdown-отчёт
Открыть полный отчёт →
Анализ ветеринарных данных
Ветеринарная медицина · 3 группы животных

Анализ безопасности препарата для лечения и профилактики тромбоза

Доклинический анализ биохимических и гематологических показателей у кошек и собак до/после введения препарата. Тепловые карты частот отклонений, статистические тесты по каждому показателю с визуализацией p-value, разделение по типу терапии и виду животного.

  • 30+ показателей крови
  • Парные тесты «до/после»
  • Тепловые карты + p-value plots
  • Сравнение видов
Группа 1 Группа 2 Группа 3
Forest plot Cox-регрессии
Кардиология · УЗДГ

Остаточный непараметрический анализ показателей УЗДГ при ХСН

Двухэтапный подход: сначала линейные модели с поправкой на возраст и пол, затем Краскел–Уоллис на остатках с пост-хок тестом Данна. Решает проблему конфаундеров без потери непараметрической устойчивости. Полный методический разбор в отчёте — почему именно так, а не ANOVA «в лоб».

  • Линейная регрессия + Kruskal–Wallis
  • Пост-хок Dunn с FDR
  • Боксплоты по классам ХСН
  • Методический разбор
Открыть полный отчёт →
Кривые Каплана-Майера
Демо-кейс · Анализ выживаемости

Выживаемость в РКИ: Kaplan–Meier + многофакторная модель Кокса

Демонстрационный анализ на синтетических данных: оценка эффекта терапии на выживаемость с поправкой на возраст, пол и стадию заболевания. Кривые Каплана–Майера с 95% ДИ, log-rank тест, forest plot отношений рисков, проверка пропорциональности рисков.

  • Kaplan–Meier + log-rank
  • Cox PH с ковариатами
  • HR с 95% ДИ
  • n = 240
KM curve Forest plot
Volcano plot
Демо-кейс · Биоинформатика

Дифференциальная экспрессия генов: RNA-seq анализ

Демонстрация полного пайплайна для транскриптомных данных: t-тесты по 8000 генов с поправкой Бенджамини–Хохберга, volcano plot для визуализации DEG, тепловая карта топ-30 генов с z-нормировкой, PCA образцов с 95% доверительными эллипсами.

  • 8000 генов · 24 образца
  • BH-поправка (FDR < 5%)
  • Volcano + heatmap + PCA
  • 116 ↑ / 127 ↓ DEG
Volcano Heatmap PCA

Как мы работаем

Прозрачный процесс. Вы знаете, что и когда получите.

  1. 01

    Бриф и оценка

    Обсуждаем задачу, дизайн исследования, доступные данные. Бесплатно оцениваем объём работы и сроки. Подписываем NDA при необходимости.

  2. 02

    План анализа

    Готовим Statistical Analysis Plan: какие гипотезы, какие тесты, какие поправки, какие визуализации. Согласуем с вами до начала работы.

  3. 03

    Анализ и отчёт

    Проводим анализ в R/Python, готовим воспроизводимый Rmarkdown-отчёт с кодом, графиками и интерпретацией каждого результата.

  4. 04

    Консультация и сопровождение

    Разбираем результаты на видеозвонке, помогаем со словесной интерпретацией для статьи или диссертации, отвечаем на правки рецензентов.

Обсудить проект

Опишите задачу — мы ответим в течение 1 рабочего дня и предложим оценку объёма и сроков. Первичная консультация бесплатна.

NDAЗащита данных по запросу
R · PythonВоспроизводимый код
1 деньСреднее время ответа

Нажимая кнопку, вы соглашаетесь на обработку персональных данных. Мы не передаём данные третьим лицам.